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1846年7月，医院迁入麦家圈新院舍，因院址坐落于山东路，俗称山东路医院（Shantung Road Hospital），亦称“仁济医馆”。1952年11月29日，经华东军政委员会卫生部批准，医院由上海第二医学院接管成为其附属医院。随后于1966年和1972年分别更名为上海第二医学院附属工农兵医院、上海第二医学院附属第三人民医院。

第十三届全国人大常委会副委员长、中国科学院院士、四大慢病重大专项技术总师陈竺，上海市副市长陈宇剑，上海市政协副主席金兴明，上海市人大常委会委员、市人大侨民宗委、外事委主任委员黄红，中国科学院院士、上海交通大学校长丁奎岭等出席开幕式。

跨越三个世纪，历经180个春秋，仁济医院创造了无数中国和世界医学史上的传奇，全国首家护校、国内首个骨科病房、中国第一台人工心肺机、首例针刺麻醉下心内直视手术等，都诞生于仁济医院。医院培养了一大批仁心仁术、勇于创新的医学人才，如：中国内科学奠基人黄铭新，中国外科学奠基人兰锡纯，中国第一批工程院院士、中国消化病学奠基人江绍基……他们为西医在中国的发展立下了一座座里程碑。

在数字化方面，仁济医院坚持数字赋能发展，“便捷就医服务”七大场景已全部落地，在全市最早实现医疗费用脱卡线上支付，已与全市9个区51家养老机构签约建设云诊室，“互联网医院+养老院”创新模式覆盖超过1.9万张床位；在人才培养方面，2014年，在仁济医院成立的上海—渥太华联合医学院，开创了临床医学专业本科教学国际化改革先例；2019年与法国医学科学院和斯特拉斯堡大学医学院合作共建“中法外科学院”，标志着医学教育国际化再进一步。

资料显示，多年来，仁济医院门急诊人次、住院手术人数常年居上海市第一，多个重点学科连续多年在复旦专科排行榜上位居全国前列，其中消化学科连续5年在复旦版医院专科声誉排行榜中名列第一，肝移植手术量连续13年保持全国第一，儿童肝移植手术例数连续11年居全球首位。

1984年，医院名字恢复为上海第二医学院附属仁济医院。1985年，更名为上海第二医科大学附属仁济医院，2005年又更名为上海交通大学医学院附属仁济医院。

新濠博亚娱乐平台在迎接建院180周年之际，仁济医院院史馆完成升级改造，以全新的面貌亮相。这一展馆生动展现百年仁济的红色基因和爱国情怀，还将医学科普的概念引入其中，在大器官移植的展区，包括肝、肾、心、肺、小肠、胰岛、角膜、骨髓移植在内的8种移植技术，以裸眼3D的形式呈现给参观者。

资料显示，1844年2月18日，英国医师雒魏林（William Lock- hart）在上海县城大东门外一所民房内，创办中国医院(Chinese Hospital)，这也是仁济医院的前身，同时是上海最早的西医医院。同年6月，医院迁到上海小南门外南仓张家衖，能容纳30多个住院病人。