台湾《经济日报》同日刊发社论指出，大陆一直都是台湾最重要的经贸伙伴，也是台湾最重要的出口地区，台湾不能放弃大陆市场。

该篇社论表示，如果现在的状况持续下去，两岸经贸长期萎缩，对于台湾出口的动能与经济增长势必造成重大伤害，台湾必须要严肃处理这一问题。

利记网站岛内有学者5月31日投书中时新闻网分析指出，这次中止的项目，触及了台湾石化、纺织和机械等传统产业，很多都相当依赖大陆市场。在没有免税的待遇下，这些产业将难以与东南亚及日韩等国企业竞争，只能考虑关闭在台工厂。

该学者表示，传统产业是相对劳动密集的行业，大量流失会让制造业出现较多失业，更会让台湾的产业结构进一步失衡。台湾将面对更大的产业波动风险，以及劳工“所得分配”的进一步恶化，甚至产生治安恶化的社会问题。

台湾《工商时报》6月1日发表题为“台湾对大陆路线的谬误与风险”的社论指出，在台湾与大陆经贸链接如此之深的情况下，民进党当局不但无法有效建立与大陆沟通协商的管道，而且对于化解大陆对台经贸制裁，例如立即检讨对陆管制的2509项大陆制产品，并在合理情境下开放，可以说是毫无作为。